一、办公室

组织协调局机关政务工作；负责政治学习、文秘、信息、信访、机要、保密、档案、提案、目标管理督查、考核工作；负责局机关财务、房产、后勤行政管理等工作。负责局机关和下属单位的人事、劳动工作，管理局机关离退休人员；指导、协调交通行业岗位培训、职工队伍建设。

二、计财处

组织编制全市交通建设发展中、长期规划；编制全市公路、水运年度投资建议计划并负责初审；安排市级公路、水运建设年度投资计划；负责综合统计、预测、科技、信息引导工作；负责管理交通规费，会同有关部门筹集交通建设资金并对资金使用进行监督；负责所属企业的技术改造项目计划的编制管理；对项目的预决算和局属单位的财务预决算进行初审，负责交通专项资金和局属单位经费使用的监督和内部审计，指导全市交通行业的财务与审计工作。

三、建管处

组织协调公路、水路工程项目建设，负责限下项目初步设计审查、审批和限上项目的审查、报批；组织公路、水路工程项目的竣工验收；负责交通工程项目招投标、监理、工程质量技术监督和定额工作的管理及施工企业和设计单位的资质审查和年检工作；会同有关部门管理交通基础设施建设市场，维护公路、水路建设行业平等竞争秩序；根据工程进度提出工程拨款建议。

四、运安处

组织制定全市交通运输行业发展规划，提出行业管理的政策措施，并监督执行；负责全市道路、水路运输行业管理与协调；负责交通运输行业的市场准入审批管理工作；指导、协调全市路政管理工作；负责汽车租赁业管理与协调，负责运价制订、票证管理、联合运输等综合性协调工作；协调、督促重点物资、紧急物资运输和假日运输、抢险救灾、军运任务的完成；负责全市交通系统文明单位、文明行业创建工作的组织指导；指导全市交通运输行业安全管理；指导、协调全市渡口安全管理及监督工作；指导企业内部改革；指导、协调出租车管理工作；参与重大以上交通事故的调查处理；协助、配合有关部门管理车站港口文码头)的治安工作。

五、法制处

指导全市交通行业的法制工作；负责草拟有关交通行政管理的地方规范性文件；负责交通系统的执法监督、岗位培训和行政复议工作，并负责局本级行政诉讼的出庭应诉工作；受理对全市交通行业违法违章行为的举报、投诉工作，并负责处理、协调。

六、交战办

管理交通环境保护工作；负责交通战备日常工作。

七、纪检监察室

负责交通系统日常纪检工作。